はい、AMC Manager StandardおよびAMC Manager Freeでは、拡張子「cfgx」のパスワード付き暗号化設定ファイルを指定できます。
設定ファイルを指定する際に、そのファイルのパスワードを入力してください。
通常の拡張子「cfg」の設定ファイルも指定できます。