AMC Managerが導入されているPCと検索対象のNetDAが無線LANで接続されていることはありませんでしょうか。  
サイトサーベイを実施している間は、アクセスポイントとしての動作を停止させた後、無線環境の調査用の処理が行われますので、AMC Managerが導入されているPCとの無線LAN接続も切れます。