C-6800GBは、PCからのデータを複合機のUSBへ送受信するのみであり、C-6800GB自体が、NW上のPCへ直接影響を与えることはございません。    
また、C-6800GBはsilex独自OSで動作しており、C-6800GB自体がウィルスに感染することもございません。    
ただし、ウィルスがUSBポート経由で感染する場合にはC-6800GB経由での印刷またはSVL接続を行った際に  ウィルス感染する可能性がございます。    
参考  
上記USBポート経由でウィルス感染する可能性については、複合機側の範疇となりますので、機器メーカ(キヤノン様)にご確認いただくようお願いいたします。