SX Virtual Linkのスタートアップ登録はユーザーごとに設定されており、ユーザーでログインしないと起動しません。また、タスクバーの通知領域でアイコンが隠れている場合やWindowsのセキュリティポリシーによりスタートアップが無効になっている可能性もあります。